Badania y-dna37 +mtdna

[whanak]

No dobra.. w raw data mam SNP,
ze strony http://www.isogg.org/tree/ISOGG_YDNA_SNP_Index.html
oraz https://www.familytreedna.com/advanced- ... tions.aspx
wiem co sprawdzać, ale jakie wartości mówią że mutacja jest + a kiedy jest - ??

Pozdrawiam
W.

[misty69]

W 23andme powinienes miec wszystko omowione automatycznie. Jesli dla danego SNP lub zbiorow SNP pojawia sie nowe ustalenia to bedzie to wykazane na Twoim profilu po zalogowaniu.
SNP porownuje sie do SNP referencyjnego. W pierwszym linku ktory podales jest to wyjasnione. "Chromsome Y locations that are listed on the ISOGG web pages are based on Human Genome Assembly NCBI36 (UCSC hg18). A revised version, Human Genome Assembly GRCh37 (UCSC hg19), is currently coming into use. Chromosome Y locations based on GRCh37 are different than those based on NCBI36.
References: NBCI, UCSC FAQ
"
Raw data mozesz przepuscic przez program ze strony http://www.snpedia.com/index.php/SNPedia . Czas trwania obrobki pliku to cos ponad 1 godzine.
Na samym dole masz tam plik promethease.exe
misty69
Co do SNP na y-dna to codziennie odkrywane sa nowe. Ostatnio FTDNA sprzedawala po 500$ tzw FGS na y-dna. Dziennie sa w stanie obrobic 2 probki DNA.

done . . sample id . country . . . haplogroup info . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . new snps
====== . ========= . =========== . ======================================================= . ===================
01 Apr . GRC002489 . England . . . J-L26 M47- M322- M92- M163- L210- M319- M339- M419- L24-. none
.. ... . . private snps: L559+ L556- L558- L560-
01 Apr . GRC001137 . England . . . R-L3 L20- L135- L196- L209- L408- L409- L443- . . . . . . L562/Z50
31 Mar . GRC001834 . Poland. . . . J-M92 M327- L236- . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L556 L558 L559 L560
31 Mar . GRC002242 . Scotland. . . R-L21 M37- M222- L96- L144- L195- L193- L226- P314.2- . . L555 L557 L561
.. ... . . private snps: L9- L10- L130- L192.1- L302- L371-
30 Mar . GRC001678 . England . . . R-L21 M37- M222- P66- L96- L144- L195- L193- L226-. . . . L554
.. ... . . private snps: L9- L10- L130- L192.1- L302- L371-
30 Mar . GRC003411 . France. . . . R-L2 L20- M228.2- L3- L135- L196- L209- L408- L409- . . . L552 L553
29 Mar . GRC015940 . Lithuania . . N-M178* . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L548 L549 L550 L551
29 Mar . GRC006280 . Poland. . . . E-V13 V27- L17- L143- L241- L250- L251- L252- . . . . . . L535..L547 (n=13)
28 Mar . GRC004211 . England . . . I-L38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L533 L272.3
28 Mar . GRC001655 . India . . . . J-L192.2 L271-. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L530 L531 L532 L534
27 Mar . GRC001656 . USA . . . . . Q-M346 L53- L54- L55- L213- L331- . . . . . . . . . . . . L527 L528 L529
27 Mar . GRC000467 . Netherlands . G-L140 U1- L43- . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . none
25 Mar . GRC000383 . France. . . . R-P312 M65- M153- L21- L176.2-. . . . . . . . . . . . . . none
.. ... . . private snps: L7- L86.2- L95- L147.3- L171- L194- L220- L253- L289- L326- M228.1-
17 Mar . GRC001639 . Poland. . . . I-L69.2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . none

[misty69]

FTDNA wprowadzilo testy 111 markerowe. Upgrade z 67 do 111 markerow - 101$.
W projekcie Polska jest juz 2167 wynikow DNA http://www.familytreedna.com/group-join ... oup=Polish
15 kwietnia jest dzien DNA i prawdopodobnie mozna spodziewac sie jednodniowej promocji na badania.
pzdr
misty69

[whanak]

Tylko DZIŚ 23andme.com ma promocję;

kit 0$ + 96,95$ za przesyłkę + 9$ subskrypcja miesięczna (min. 12msc.)

http://spittoon.23andme.com/2011/04/11/ ... th-a-sale/

Pozdrawiam
W.

[whanak]

Promocja się właśnie skończyła, za to regularna cena spadła do 99$ +wysyłka + subskrypcja.

Pozdrawiam
W.

[misty69]

15 kwietnia bedzie 1-no dniowa promocja w familytreedna.com

misty69

[whanak]

...i już się właśnie zaczęła.

jednak nie poszaleli ;

DNA Day is April 15th! Starting at 12:00 PM on April 14th, join the celebration!

New customers:
Y-DNA12…… $59
Y-DNA37…… $129
...mtDNA……… $59
Family Finder… $199
Family Finder + Y-DNA12… $258
Family Finder + mtDNA…… $258
Family Finder + mtFullSequence + Y-DNA67 … $657

Upgrades:
Y-DNA12 add-on … $59
Y-DNA12 to 37…… $69
Y-DNA37 to 67…… $79
Y-DNA12 to 67…… $148
mtDNA add-on …… $59
mtFull Sequence upgrade … $199
Family Finder add-on … $199

To take advantage of these promotional prices use the coupon code: DNADAY2011

The coupon code will expire on Friday at midnight (CT).

Please note, the Y-DNA67 to 111 upgrade will remain at the introductory rate of $101 (no coupon necessary) until the end of this promotion. The price will be $129 going forward.



Payment must be received at the time of the order. Valid only on products listed. No substitutions. This promotion was announced in advance, therefore no adjustments will be made on previous purchases. Offer valid from 12:00 PM CT on Thursday, April 14, until 11:59 PM CT on April 15, 2011.

This promotion is not valid in combination with any other promotions. Family Tree DNA reserves the right to cancel any order due to unauthorized or ineligible use of discounts and to modify or cancel these promotional discounts due to system error or unforeseen problems. Subject to change without notice.

w temacie rozszerzenia 67 markerów do 111 to jednak nie skorzystam..

Pozdrawiam
W.

[misty69]

Faktycznie, a do tego jak rozumiem tylko upgrady. Eh.
misty69

[whanak]

Zarówno nowi klienci jak i upgrade;

New customers:
[...]
Upgrades:
[...]

W.

[misty69]

tak zauwazylem i wrociłem:-)
misty69

[Lala]

Zastanawiam się nad testem z 23andme.
Whanak - czy możesz napisać w jakiej formie podany jest wynik Y-DNA i mtDNA z 23andme za 99$.
I czemu to z grubsza odpowiada w "familytreedna" (jest tam duży wybór: Y-DNA (12,37,67,111) i mtDNA (opcaj mtDNAPlus)?

Z góry dzięki :)

[whanak]

Te badania nie są w zasadzie porównywalne.

Jedyne co można porównywać, to informacja o haplogrupie.

Dane są udostępniane w formie raportów - głównie nt. predyspozycji do chorób, działania niektórych leków czy nt. predyspozycji psychofizycznych.
Dane o pokrewieństwie z innymi osobami w bazie pozwalają porównywać fragmenty genotypu - w zależności od poziomu zezwolenia na tę czynność.
Dodatkowo - można pobrać dane w postaci pliku RAW i poddać go analizie w aplikacjach zewnętrznych np. promethease.
To tak w dużym skrócie.

Zlecając badania tego typu, należy najpierw odpowiedzieć sobie na pytanie, czy jest się gotowym usłyszeć złe nowiny, gdyby takie się pojawiły...

pozdrawiam
W.

[Lala]

Jeszcze tyko jedno pytanie - czy haplogrupa jest dokładna (np.R1b1a2a1a1a, czy jest to tylko skrócone np. R1b1). Bo mitochondtrialne DNA pewnie oznaczone jest tylko jedną litera?

[tomcyb]

Zlecając badania tego typu, należy najpierw odpowiedzieć sobie na pytanie, czy jest się gotowym usłyszeć złe nowiny, gdyby takie się pojawiły...

Masz na myśli podatność na choroby czy coś innego?

[whanak]

Podatność na choroby także - bo np. niektórzy jeśli zobaczą, że mają np 100% wyższą szansę (w porównaniu do średniej) zachorować na to czy inne schorzenie, to mogą popaść w złe samopoczucie - pomimo tego, że np średnia w populacji jest 1 na 10 000.
To się często bierze z utożsamiania różnicy w prawdopodobieństwie z samym prawdopodobieństwem;

vide - jeśli przeciętnie choruje 1 na 10 000 to przy 100% wyższym prawdopodobieństwie będzie to 2 na 10 000 czyli nadal mało

Druga - poważniejsza sprawa to panel z informacjami o nosicielstwie chorób genetycznych - może się zdarzyć, że pojawi się tam znacznik "wariant obecny" co oczywiście nie musi oznaczać pełnopostaciowej choroby - ale stres może wywołać.
Dlatego informacje o niektórych chorobach (jeśli nie cały panel nosicielstwa - nie pamiętam) wymaga dodatkowego potwierdzenia , że chce się wiedzieć co tam jest zawarte.

Dodatkowo - może się tak zdarzyć, że jeśli badania są rodzinne (dziecko-rodzic) - to może się okazać, że nie są ze sobą biologicznie spokrewnieni...
Biorąc pod uwagę, że podobno 10% ojców wychowuje nie swoje dzieci (zasłyszane, nie mam opracowań nt temat) to jest to trochę jak "rosyjska ruletka"

Pozdrawiam
W.